Diez años después del final de la guerra contra el Dr. Hell y sus Bestias Mecánicas, el mundo vive una era de paz gracias al desarrollo de la energía fotónica con fines pacíficos. El piloto de Mazinger Z, Koji Kabuto, se ha convertido en un distinguido científico, después de su padre y su abuelo, mientras que Sayaka Yumi es ahora la directora del Instituto de Investigación de Fotones, después de que su padre, el Dr. Yumi, se convirtiera en Primer Ministro de Japón. El piloto de Gran Mazinger, Tetsuya Tsurugi, todavía está en el ejército y está casado con Jun Hono, quien está esperando su primer hijo. El hermano menor de Koji, Shiro, también es piloto de mechas militares.